Программа подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре проводится в Центре по научным специальностям:
3.1.17 — «Психиатрия и наркология»;
3.1.24 — «Неврология».

К освоению программ подготовки научно-педагогических кадров в аспирантуре допускаются лица, имеющие высшее медицинское образование. Вступительные испытания проводятся в форме экзамена по иностранному языку, философии, специальности.
Программа аспирантуры включает в себя научный компонент, образовательный компонент, а также итоговую аттестацию.
Научный компонент программы аспирантуры включает: научную деятельность аспиранта, направленную на подготовку диссертации на соискание научной степени кандидата наук к защите; подготовку публикаций, в которых излагаются основные научные результаты диссертации, промежуточную аттестацию по этапам выполнения научного исследования.
Образовательный компонент программы аспирантуры включает дисциплины (модули) и практику, а также промежуточную аттестацию по указанным дисциплинам (модулям) и практике.
Итоговая аттестация по программам аспирантуры проводится в форме оценки диссертации на предмет ее соответствия установленным критериям.